错颌畸形有遗传因素和环境因素造成的。
遗传因素分为：种族演化和个体发育。
种族演化：颌骨退化的程度大于牙齿，牙量、骨量的不调。
个体发育主要表现在由颌骨大小、位置、牙弓形态、牙齿大小、数目、扭转等所致的各种错颌。常见的有下颌前突、反颌、闭锁性深覆合、上颌前突、深覆盖等错颌均可因遗传而引起。
环境因素：口腔不良习惯、口腔功能异常、儿童替牙期故障。
口腔不良习惯占错颌畸形病因的16.1%
1.吮指不良习惯。由吮拇指造成的畸形，常见的是前牙的开颌、牙间隙、深覆盖、牙弓狭窄等畸形。
2.咬下唇的不良习惯。咬下唇不良习惯可引起上前牙唇倾及下前牙舌倾，前牙出现无颌接触或开颌。主要是由于咬下唇时。唇肌紧张，推上切牙唇向、压下切牙舌向，出现开唇露齿，而造成上切牙唇向倾斜，下唇在平时的位置将卷缩在上切牙舌侧，肌的压力将使畸形更加严重，长期咬下唇者，可出现下唇周围皮肤角化。
3.吐舌不良习惯。儿童在替牙过程中吐舌，或舔萌出新牙常形成吐舌。吐舌不良习惯常造成前牙开颌，吐舌不良习惯时常有下颌前伸动作，故有时可出现前牙反颌、下颌前突。
（二）口腔功能异常
1.口呼吸。造成的错颌常用表现为牙弓狭窄、牙列拥挤、腭盖高拱、面型狭长。往往由于鼻咽部疾病而造成，多见于儿童口咽淋巴组织增大、腺样体肥大和扁桃体肥大，慢性鼻炎、鼻中隔偏斜等致鼻咽、气道狭窄或阻塞。
2.吞咽异常。正常吞地牙齿咬合在正中位，舌尖压于腭部邹襞，舌的压力向后向上，软腭关闭鼻咽部。异常吞咽时，咀嚼肌不能使牙颌紧咬；而是竞争者大尖伸至上下切牙间，舌体则充塞在后牙开口间隙；这时面部表情肌紧张，而形成吞咽异常。
吞咽不良习惯的矫治，首先应矫治各种原因造成的开颌，开颌矫治后，需训练正常的吞咽动作，可以让食指放在软、硬腭交界处，让口才知道此位置，将舌尖接触此点。上下牙弓咬合，闭唇，进行吞咽训练。
（三）儿童替牙故障
1.乳牙早失。乳恒牙替换时是有一定的顺序和时间的，乳牙的过早脱落就会影响恒牙的发育和萌出位置的异常。
2.乳牙滞留。滞留乳牙的相应恒牙可在滞留牙的唇侧或颊舌侧错位萌出。滞留乳牙需用X线处检查，是否有相应恒牙胚，若恒牙胚牙根发育超过1/2，则可拔除滞留乳牙。
3.恒牙早失。第一恒牙的早期缺失造成的影响最大，在这一时期内磨牙缺失必然造成颌关系紊乱。
4.乳尖牙磨耗不足。上下乳尖牙发生早接触，下颌为躲避早接触干扰，前伸而形成假性下颌前突，前牙反颌。在早期发现乳尖牙磨耗不足时，可对其进行调颌，磨去过高牙尖。
5.先天缺失牙、额外牙、易位牙多见于下颌切牙、上颌侧切牙和前主梦魇牙。先天缺牙后可使牙弓缩小，下切牙先天缺失可造成深覆盖，上切牙先天缺失可致前牙反颌。
6.其他
1）唇腭裂：唇腭裂儿童多有错颌畸形，特别是腭儿童，裂隙侧牙常有先天缺失或埋伏，常用可表现在上牙弓拥挤、反颌。
2）唇系带发育异常：唇系带附着过低，或唇系带纤维粗壮，可造成上中切牙间间隙，影响前牙排齐；唇系带领附着过低可作唇系带切竖缝矫治术。
3）乳前牙外伤：乳前牙外伤常可致相应恒牙胚发育异常，埋伏阻生，造成错颌畸形。
